一、产品概述
托普云农GXY系列根系扫描仪(含GXY-A双光源透扫款、GXY-B高拍背光款及配套根系分析软件)是面向植物根系形态学与构型研究的离体图像分析设备。系统由高分辨率光学成像单元、背光透扫平台、样本定位附件与根系分析软件组成,针对水洗后的单株离体根系进行非接触数字化采集,替代网格纸描迹、手工丈量与目测分级等传统方式,输出根长、直径、表面积、体积、根尖与拓扑结构等标准化表型参数,服务于作物育种、逆境生理与根际生态研究。
二、工作原理
系统基于“高对比图像采集—像素标定—语义分割—骨架化拓扑重建"的技术链路。
离体根系经水洗舒展后置于高透光根盘,在双光源(透射+反射)或可调背光条件下获取无阴影彩色图像;软件以物理标尺完成像素—毫米标定,依次进行暗场校正、背景减除与色空间(RGB/ExG)阈值分割,区分根体、根瘤、残土与水膜。随后通过二值化与单像素骨架提取,将根轴转化为图结构:按Strahler或Horton规则对主根与1—8级侧根分级,计算连接关系、分支角度与路径长度。
形态量解算中,根长按骨架像素累加,表面积与体积基于局部直径柱面近似积分;颜色通道辅助判别活根、褐化根与死根,根瘤区域经色调阈值独立统计。原位扩展场景下,微根窗(Minirhizotron)探头沿透明根管旋转扫描,可对非扰动根系做时序回访,与离体扫描共同构成“过程+终点"表型数据链。
三、核心检测指标
基础形态参数
总根长、根平均数直径、直径中值、最大直径
投影面积、表面积、体积、根数、根系密度
结构与拓扑参数
根尖数、分叉数、交叠数、关节点/连接点数
分支角度、连接长度、各级(1—8级)侧根长度与占比
Strahler分级、拓扑指数、盒维数(分形特征)
分级与专项分析
直径分档统计(如细根0—0.5 mm、中根0.5—1 mm等),各档长度/面积/体积分布
根瘤计数、根瘤表面积与体积占比(豆科共生评价)
颜色分类:活根/死根长度与面积贡献
派生指标:比根长SRL、根长密度RLD(耦合生物量与土体体积)
四、功能特点
根系分析功能:
1、拓扑分析:能自动进行根系的拓扑分析,自动确定根的连接数、长度、体积等参数,可自动区分侧根等级自动分析主根或任意一支侧根的参数等,根系等级分为6级,使根系分析更加准确;
2、连接分析:可分析准确分析根系内各根段的角度关系;
3、分段测量:可通过直径、投影面积、表面积、体积和长度进行根系分段和分档,并可自定义进行分档设置,自动测量各直径段长度、投影面积、表面积、体积等,及其分布参数,并输出数据直方图,实现数据可视化
4、智能校正,结果更精准:可对根系进行合并分叉、删除连接、合并根尖、断开连接、毛刺去除、主根修正、侧根修正、根粗修正等校正,可操作性强;
5、自动剔除杂点:通过设定像素值剔除杂点,凸显目标根系轮廓;
6、自动标定:用户输入扫描像素后,软件自动换算实际长度;
7、个性化显示,观察更轻松:支持对图片分析的参数进行勾选设置,可用不同颜色显示出根系的端点、关节点、连接线段、主根、1-6级侧根和低级侧根,便于检测中的直观显示与区分;
8、图片二值化:调整图片灰度对比,更好分割根系和调整背景,使分析结果更准确;
9、还原至初始图片:可将分析或操作后的图片还原为刚打开时的状态;
10、目标区域分析:可手动选择想要测定的目标区域,只对选定的目标区域进行分析,分析更加灵活,增加数据准确性。
一键分析多项参数:一键操作,精准获取根总数、根尖数量、根总长、根平均直径、根总投影面积、根总体积、R/G/B、RHS、总连接点数、端点、关节点、连接点数、分叉数、交叠数、盒维数等多项参数;
软件加密、数据更安全:采用动态二维码+密码狗加密,登记具体使用单位的信息,防止jia密狗的丢失;
大批量全自动分析:单次可批量分析100张以上图片,自动保存分析结果,省时省力;
数据自动保存:可随时暂停或继续分析数据,数据进度自动保存;
数据导出表格化:将图片或数据导出至文件夹,数据可导出Excle格式追加至文件夹下方;
自带指尖耕耘手机app与云平台:多平台共享数据,可实时查看与导出;多平台备份数据,长期保存不防丢失
五、适用应用场景
作物育种与种质评价:量化耐密、抗旱、磷效率材料的根构型差异,补充地上性状筛选维度。
逆境生理研究:观测干旱、盐渍、涝渍、低温下细根衰退、根尖抑制与深层扎根响应。
施肥与根际管理:评估促根剂、生物刺激素、不同耕作措施对根空间分布的影响。
生态与土壤研究:细根周转、菌根侵染与碳分配过程的基础真值获取。
园艺与林木育苗:苗木根系质量分级、移栽成活潜力评价。
科研教学:建立可复核的根系数字标本库,支撑GWAS与根构型—产量关联分析。
六、科研价值与系统意义
根系是作物水分养分吸收与逆境适应的核心器官,但传统方法破坏样本、通量低、人员间误差大,难以支撑量化遗传评价。GXY系列的价值在于把“地下经验判断"转为“可重复结构变量":
以图像标定消除手工测量偏差,使不同批次、不同操作者数据可比;
同时提供形态量与拓扑量,不仅回答“根有多长",也回答“根怎么长";
细根分级与活/死根区分更贴近吸收功能与周转过程;
离体真值与原位时序观测互补,衔接冠层表型、土壤环境与产量模型。
它不替代根钻、土芯与收获生物量测定,而是补全根系构型的高通量获取环节,使“基因型—根构型—环境"解析具备稳定数据底座。
总结
托普云农GXY系列根系扫描仪以光学成像与图像智能解算为核心,构建了从根系采集、轮廓分割到形态—拓扑联合量化的标准化流程。其在根长、直径分布、表面积、分枝结构与根瘤特征等维度的同步提取能力,契合现代农学对地下部表型精准化、可追溯的需求。作为植物表型平台中的根系前端节点,该系统可服务于抗逆育种、生理生态机制解析与智慧农田管理,为理解作物地下生产潜力提供客观数据支撑。
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